ניתן לסווג מזונות פונקציונליים לארבע קטגוריות עיקריות, שלכל אחת מאפיינים ייחודיים משלה ותכונות מקדמות בריאות.
1. מזון פונקציונלי מסורתי
אלו הם מזונות שהוכרו בזכות היתרונות הבריאותיים שלהם במשך מאות שנים בתוך תרבויות שונות. לדוגמה, דגנים מלאים כמו אורז חום, שיבולת שועל ושעורה נכנסים לקטגוריה זו. הם עשירים בסיבים תזונתיים, ויטמינים ומינרלים. הסיבים בדגנים מלאים עוזרים לעיכול, מעודדים שובע ויכולים לתרום לשליטה טובה יותר ברמת הסוכר בדם. מזון פונקציונלי מסורתי נוסף הוא תה ירוק. הוא מכיל פוליפנולים, במיוחד קטכינים, בעלי תכונות נוגדות חמצון. תה ירוק נקשר עם סיכון מופחת למחלות שונות, כולל מחלות לב וסוגים מסוימים של סרטן. בתרבויות אסייתיות, הוא נצרך זה מכבר בשל השפעותיו הבריאותיות הפוטנציאליות.
2. מזונות פונקציונליים שונה
אלו הם מזונות מסורתיים שעברו שינויים כדי לשפר את התכונות הפונקציונליות שלהם. דוגמה נפוצה אחת היא מזונות מועשרים. לדגני בוקר מועשרים יש לרוב ויטמינים ומינרלים כמו ברזל, חומצה פולית וויטמינים מסוג B שונים. זה מועיל במיוחד מכיוון שהוא עוזר לאנשים לעמוד בדרישות התזונתיות היומיומיות שלהם, במיוחד לאלה שיש להם חוסרים. דוגמה נוספת היא מוצרי חלב דלי שומן. על ידי הפחתת תכולת השומן ולעיתים הוספת פרוביוטיקה, מוצרים אלו מציעים את היתרונות של מוצרי חלב (כגון סידן) תוך שהם יותר לבביים - בריאים וידידותיים למעיים. מזון פונקציונלי שונה ממלא תפקיד מכריע במתן מענה לצרכים תזונתיים ספציפיים של אוכלוסיות שונות.
3. מזון רפואי
מזונות רפואיים מנוסחים לשימוש תחת פיקוחו של רופא כדי לנהל מצבים רפואיים ספציפיים. לדוגמה, ישנם מוצרי תזונה אנטרלית המיועדים לחולים עם הפרעות ספיגה או לאלו שאינם מסוגלים לצרוך מזון דרך הפה. מוצרים אלה מנוסחים בקפידה כדי לספק את החומרים המזינים הדרושים בצורה שהמטופל יכול לסבול ולספוג. דוגמה נוספת היא מזונות שנוסחו עבור אנשים עם סוכרת. הם נועדו להיות בעלי אינדקס גליקמי ספציפי והרכב תזונתי כדי לסייע בניהול רמות הסוכר בדם ביעילות. מזונות רפואיים הם מאוד מיוחדים ומותאמים לעמוד בדרישות הייחודיות של מטופלים עם מצבים רפואיים מסוימים.
4. מזונות פונקציונליים חדשים
אלו הם סוגים חדשים יחסית של מזונות פונקציונליים שלרוב הם תוצאה של מחקר מדעי והתקדמות טכנולוגית. דוגמה אחת היא מזונות המכילים פפטידים ביו-אקטיביים. לפפטידים אלו יכולים להיות פונקציות שונות כמו הורדת לחץ דם או שיפור תפקוד מערכת החיסון. דוגמה נוספת היא מזונות פונקציונליים בתוספת פיטוסטרולים. פיטוסטרולים יכולים לעזור להפחית את ספיגת הכולסטרול במעיים, ובכך להשפיע לטובה על בריאות הלב. מזונות פונקציונליים חדשניים מציעים אפשרויות מרגשות לשיפור הבריאות ומניעת מחלות באמצעות תכשירי מזון חדשניים.